Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms