Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.8 ms