Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms