Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms