Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdh20Q9Z0M3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cdh20Q9Z0M3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh20Q9Z0M3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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