Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clcn5Q9WVD4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms