Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms