Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam50bQ9WTJ8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam50bQ9WTJ8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms