Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1Q9R1Q9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms