Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Npas3Q9QZQ0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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