Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn8Q9QZ49 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms