Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tomm40Q9QYA2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms