Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcnip3Q9QXT8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms