Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms