Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Mid2Q9QUS6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms