Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUP5

Hapln1, Hyaluronan and proteoglycan link protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln1Q9QUP5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hapln1Q9QUP5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms