Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl2Q9QUK0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms