Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms