Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms