Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nova1Q9JKN6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms