Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms