Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms