Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Alyref2Q9JJW6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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