Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms