Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms