Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
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