Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms