Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb3Q9ERD7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms