Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tfcp2Q9ERA0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tfcp2Q9ERA0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms