Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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