Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms