Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pold3Q9EQ28 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pold3Q9EQ28 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms