Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms