Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp1aQ9EPL5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1aQ9EPL5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms