Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms