Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Swt1Q9DBQ9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms