Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtr1Q9DBC3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms