Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smg9Q9DB90 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms