Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms