Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fip1l1Q9D824 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms