Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms