Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cldn22Q9D7U6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cldn22Q9D7U6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cldn22Q9D7U6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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