Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nop56Q9D6Z1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms