Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ptp4a3Q9D658 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ptp4a3Q9D658 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms