Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Zcchc13Q9D548 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Zcchc13Q9D548 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Zcchc13Q9D548 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Zcchc13Q9D548 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Zcchc13Q9D548 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Zcchc13Q9D548 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Zcchc13Q9D548 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Zcchc13Q9D548 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zcchc13Q9D548 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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