Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
4930564D02RikQ9D4S4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms