Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf6Q9D4J7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms