Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D7

Tmem30c, Cell cycle control protein 50C, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30cQ9D4D7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem30cQ9D4D7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem30cQ9D4D7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms