Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsph14Q9D3W1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms