Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt20Q9D312 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms